Nvidia och Institute for Protein Design vid University of Washington presenterade den 21 oktober RFD4-Proteina. AI-modellen ska hjälpa forskare att utforma nya proteiner och välja vilka förslag som är värda att testa i laboratoriet. Möjliga användningsområden är framtida läkemedel och tester som upptäcker sjukdomar.
Proteinets byggstenar och form utformas samtidigt
Proteiner fungerar som molekylära verktyg. Med RFD4-Proteina kan forskare ange exempelvis vilken annan molekyl ett nytt protein ska fästa vid. Modellen föreslår sedan både proteinets byggstenar och hur de ska ordnas i en tredimensionell struktur, i stället för att dela upp arbetet mellan flera modeller.
Utvecklarna redovisar ett jämförande datortest med 24 målproteiner. Där tog modellen fram omkring 76 strukturellt olika förslag per grafikkortstimme som klarade bestämda beräkningskrav. Jämförelsemetoden Proteina-Complexa nådde omkring 13.
Det betyder inte att 76 fungerande läkemedel skapades. Siffrorna gäller förslag som klarade datorbaserade kontroller, inte bevisad effekt i biologiska experiment. Resultaten kommer dessutom från utvecklarna själva.
Den praktiska möjligheten är att forskare kan få fler lovande alternativ att undersöka med samma beräkningsresurser. Men laboratorieförsök behövs fortfarande för att avgöra om proteinerna faktiskt fungerar som tänkt. Nyheten gäller alltså ett verktyg för forskningens tidiga steg, inte en färdig behandling.
Källor
Läs också
Ämnen i artikeln
- RFD4-Proteina
- AI & Forskning
