HuggingFaceBio har släppt Carbon-A, ett AI-verktyg som letar efter möjliga gener direkt i DNA. En tillhörande databas omfattar 566 miljoner förutsagda genregioner hos över 22 000 arter. Syftet är att hjälpa forskare att tolka redan kartlagd arvsmassa. Nyheten presenterades den 8 oktober.
Laboratorietester ger stöd men lämnar viktiga frågor öppna
Carbon-A söker efter DNA-avsnitt som kan innehålla instruktioner för att tillverka proteiner. Modellen kan användas för bland annat djur, växter och svampar och ger varje föreslagen gen en poäng för hur säker förutsägelsen bedöms vara.
Forskargruppen har också jämfört vissa förutsägelser med laboratoriemätningar från katt, hamster, kyckling och växten backtrav. Mätningarna gav stöd för flera regioner som modellen pekat ut men som saknades i referensdatabasen.
Det betyder inte att alla databasens förslag är bekräftade gener. Laboratorietesterna visar att vissa regioner avläses till RNA, ett mellanled när celler använder informationen i DNA. De bevisar ännu inte att proteiner tillverkas eller vilken funktion dessa i så fall har.
Både modellen och databasen är tillgängliga för andra forskare. Den praktiska vinsten är ett större underlag för fortsatta undersökningar, särskilt av dåligt studerade arter. Resultatet bör alltså läsas som en samling forskningsspår att pröva, inte som 566 miljoner färdiga upptäckter.
Källor
Läs också
Ämnen i artikeln
- Carbon-A
- AI & Forskning
